Base de données sur les brevets canadiens / Sommaire du brevet 2888949 

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Disponibilité de l'Abrégé et des Revendications

L'apparition de différences dans le texte et l'image des Revendications et de l'Abrégé dépend du moment auquel le document est publié. Les textes des Revendications et de l'Abrégé sont affichés :

  • lorsque la demande peut être examinée par le public;
  • lorsque le brevet est émis (délivrance).
(12) Demande de brevet: (11) CA 2888949
(54) Titre français: METHODE ET COMPOSITIONS ASSOCIEES POUR DETECTER UN ACIDE NUCLEIQUE CIBLE DANS DES ECHANTILLONS BIOLOGIQUES ET DES LIQUIDES ORGANIQUES
(54) Titre anglais: METHOD AND ITS COMPOSITIONS FOR DETECTION OF NUCLEIC ACID TARGET FROM BIOLOGICAL SAMPLES AND BODY FLUIDS
(51) Classification internationale des brevets (CIB):
  • C12Q 1/68 (2006.01)
  • C12N 1/06 (2006.01)
(72) Inventeurs (Pays):
  • TULP, INDREK (Estonie)
  • KROLOV, KATRIN (Estonie)
  • LEHES, MARKO (Estonie)
  • LANGEL, ULO (Suède)
(73) Titulaires (Pays):
  • SELFDIAGNOSTICS OU (Estonie)
(71) Demandeurs (Pays):
  • SELFDIAGNOSTICS OU (Estonie)
(74) Agent: AIRD & MCBURNEY LP
(45) Délivré:
(86) Date de dépôt PCT: 2013-10-20
(87) Date de publication PCT: 2014-04-24
(30) Licence disponible: S.O.
(30) Langue des documents déposés: Anglais

(30) Données de priorité de la demande:
Numéro de la demande Pays Date
61/716,495 Etats-Unis d'Amérique 2012-10-20

Abrégé français

Cette invention concerne une méthode rapide de prétraitement d'un échantillon qui permet de détecter avec une extrême sensibilité et une extrême spécificité un acide nucléique cible (par exemple l'ADN du génome humain, l'ADN du génome d'un pathogène de l'homme, l'ADN du génome d'un agent non pathogène de l'homme) par amplification directe de matériel génomique contenu dans des lysats d'échantillons biologiques non purifiés bruts prélevés chez l'homme (par exemple des échantillons d'urine, de salive, de sang, des prélèvements de l'urètre et du col de l'utérus et d'autres échantillons contenant du matériel biologique). En particulier, la méthode de prétraitement d'un échantillon biologique selon l'invention permet aux cellules de l'homme et du pathogène de libérer rapidement leur matériel génomique. L'invention concerne également des composants compatibles avec la méthode d'amplification de l'acide nucléique décrite ci-dessous. A titre d'exemple, l'invention décrit également des protocoles et des séquences d'amorces pour l'amplification isotherme de l'acide nucléique [amplification par recombinase-polymérase (ARP), technique d'amplification isotherme de l'ADN induite par boucle (LAMP)], qui permettent d'établir un diagnostic extrêmement spécifique et sensible du matériel génomique de l'Homo sapiens, de Chlamydia trachomatis et de Mycoplasma genitalium à partir de lysats d'échantillons biologiques bruts et/ou d'ADN total purifié. L'amplification utilisée peut être associée à la détection d'un produit immunochromatographique sur bandelettes à écoulement latéral et permet une amplification isotherme rapide de l'acide nucléique (moins de 20 minutes) pour le diagnostic de C. trachomatis et de M. genitalium dans des échantillons urinaires recueillis chez l'homme. La méthode selon l'invention ne nécessite pas d'équipement de laboratoire spécifique ni de personnel qualifié, et convient donc parfaitement aux applications effectuées au point d'intervention.


Abrégé anglais

Current invention is directed for rapid sample pretreatment method that allows highly sensitive and specific detection of target nucleic acid (e.g. human genomic DNA, human pathogen genomic DNA, human non-pathogen genomic DNA) by amplification directly from crude unpurified biological samples lysates (e.g. human 5 urine, saliva, blood, urethra and cervical swabs and other samples containing biological material). Invention is focused on the description of the biological sample pretreatment method that enables fast release of the genomic material from human and pathogen cells, components of what are compatible with the following nucleic acid amplification method. As an example of the application, 10 invention also discloses protocols and primer sequences for isothermal nucleic acid amplification (recombinase polymerase amplification RPA, loop-mediated isothermal amplification - LAMP), that enable highly specific and sensitive diagnostics of the genomic material from Homo sapiens, Chlamydia trachomatis and Mycoplasma genitalium from crude biological sample lysates and/or purified 15 total DNA. The example amplification can be combined with immunochromotographic product detection using lateral-flow strips and allows rapid (under 20 min) isothermal nucleic acid amplification based C. trachomatis and M. genitalium diagnostics from human urine samples, that does not require specific laboratory equipment nor qualified personnel, and is therefore well suited 20 for point-of-care settings applications.


Note : Les revendications sont présentées dans la langue officielle dans laquelle elles ont été soumises.


19

CLAIMS

1. A method for detection of nucleic acid target from biological samples and
body
fluids comprises following steps:
a) sample pretreatment comprising cell lysis and release of nucleic acid
targets in biological samples and body fluids;
b) amplification of nucleic acid(s);
c) detection of amplification product(s),
wherein lytic peptides are used to release nucleic acid targets in biological
samples or body fluids.
2. The method according to claim 1, wherein detergents are used to release
nucleic acid targets in biological samples or body fluids.
3. The method according to claim 1, wherein combination of lytic peptides and
detergents are used to release nucleic acid targets in biological samples or
body fluids.
4. The method according to claim 1, wherein one or more specific target based
sequences are amplified.
5. The method according to claim 1, wherein sample solution obtained during
the
step (1) is directly subjected for further amplification procedure.
6. The method according to claim 1, wherein qualitative and quantitative
detection
is performed with crude sample solution.
7. The method according to claim 1, wherein the Chlamydia trachomatis nucleic
acid target(s) with the use of specific target region provided in Table 1 is
detected.
8. The method according to claim 1, wherein the Mycoplasma genitalium nucleic
acid target(s) with the use of specific target region provided in Table 1 is
detected.
9. The method according to claim 1, wherein the Chlamydia trachomatis nucleic
acid target(s) the use of specific primer(s) and/or its labeled derivative(s)
sequences provided in Table 2 and 3 is detected.


20

10. The method according to claim 1, wherein the Mycoplasma genitalium nucleic

acid target(s) with the use of specific primer(s) and/or its labeled
derivative(s)
sequences provided in Table 2 and 3 is detected.
11. The method according to claim 1, wherein the human genomic GAPDH target
is used for detection as an internal validation and platform assessing
technique.
12. The method according to claim 1, wherein the human genomic GAPDH target
is used for detection as an internal validation and platform assessing
technique
with specific primer(s) and/or its labeled derivative(s) sequences provided in

Tables 2, 3.
13. A molecular diagnostics method of Chlamydia trachomatis, wherein the TRPB
gene is used as molecular diagnostics target.


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États admin

Titre Date
(86) Date de dépôt PCT 2013-10-20
(87) Date de publication PCT 2014-04-24
(85) Entrée nationale 2015-04-21

Taxes périodiques

Description Date Montant
Dernier paiement 2017-10-03 50,00 $
Prochain paiement si taxe applicable aux petites entités 2018-10-22 100,00 $
Prochain paiement si taxe générale 2018-10-22 200,00 $

Avis : Si le paiement en totalité n’a pas été reçu au plus tard à la date indiquée, une taxe supplémentaire peut être imposée, soit une des taxes suivantes :

  • taxe de rétablissement prévue à l’article 7 de l’annexe II des Règles sur les brevets ;
  • taxe pour paiement en souffrance prévue à l’article 22.1 de l’annexe II des Règles sur les brevets ; ou
  • surtaxe pour paiement en souffrance prévue aux articles 31 et 32 de l’annexe II des Règles sur les brevets.

Historique des paiements

Type de taxes Anniversaire Échéance Montant payé Date payée
La surtaxe pour paiement en souffrance 200,00 $ 2015-04-21
Dépôt 200,00 $ 2015-04-21
Taxe périodique - Demande - nouvelle loi 2 2015-10-20 50,00 $ 2015-10-07
Taxe périodique - Demande - nouvelle loi 3 2016-10-20 50,00 $ 2016-10-03
Taxe périodique - Demande - nouvelle loi 4 2017-10-20 50,00 $ 2017-10-03

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Description du
Document
Date
(yyyy-mm-dd)
Nombre de pages Taille de l’image (Ko)
Abrégé 2015-04-21 1 78
Revendications 2015-04-21 2 55
Description 2015-04-21 18 884
Page couverture 2015-05-19 1 50
PCT 2015-04-21 16 502
Taxes 2015-10-07 1 33
Correspondance 2016-01-19 2 58
Correspondance 2016-01-29 1 25
Correspondance 2016-01-29 1 34
Correspondance 2016-02-05 4 113
Correspondance 2016-02-26 1 26
Correspondance 2016-02-26 1 28
Correspondance 2016-11-15 2 42